1. Sezon

İlk bölüm, Smallville'e çarpan ve Kansas kasabasındaki hayatı sonsuza dek değiştiren meteor yağmurunun hikayesini anlatıyor. Clark Kent, Lex Luthor'la ilk kez tanışır ve Dünya'ya yolculuğunda ona eşlik eden garip yeşil meteor kayaları tarafından mutasyona uğratılmış uzun bir insan soyunun ilkiyle karşılaşır.

Clark, Lana'ya ilgi duyan ve çeşitli böceklerin yeteneklerini kazanarak karşısına çıkan herkese saldıran inek tipi bir böcek koleksiyoncusu Greg ile uğraşmak zorundadır.

Kötü niyetli ve öfkeli bir futbol koçu, ateşi kontrol etme ve yayma yeteneği kazanır.

Clark begins experiencing "vision problems" as his x-ray vision begins manifesting. Meanwhile a mysterious shapeshifter is going about town using his or her abilities to steal and get others in trouble.

Sean adında bir sporcu, etrafındaki her şeyden ve herkesten ısı emme yeteneği kazanır ve hayatta kalmak için ihtiyaç duyduğu ısıyı elde etmek adına insanları avlamaya başlar.

Yaşlı bir adam, yeşil meteor kayasını kullanarak yaşlanma sürecini tersine çevirir ve onu yıllar önce hapse attıran jürinin çocuklarından intikam alır. Bu sırada, aynı huzurevindeki başka bir kadın kehanet yeteneğine sahiptir ve hem Clark'ın hem de Lex'in geleceğini görür.

A weight-obsessed teen dieting on kryptonite-infected vegetables gains her fondest dream...but must feed on the fat of others to maintain her enhanced appearance.

Luthor gübre fabrikasındaki bir deney, Kent ailesinin eski bir dostunu kelimenin tam anlamıyla sallayıp titretir ve adam, dönüşümünün sırrını yerel fabrikadaki 'Üçüncü Seviye' adı altında saklayan Luthor'lardan intikam almaya çalışır.

Clark, Metropolis'i ziyaret eder ve gizli bir iyilik yapar - bir polis dedektifi buna tanık olur ve araştırmaya karar verir.

Lex ve Victoria, evlerinde sandıkları bir poltergeistin kurbanlarıdır. Rahatsızlıklar şiddetlendikçe şüpheler, Lex'e takıntılı olan hizmetçinin kızı Amy'nin üzerine yoğunlaşır. Her şey göründüğü gibi değildir...

Metropolis'e, LuthorCorp'a rakip bir gübre firmasının sorumlusu olan bir adam gelir. Amacı, Kent çiftliğini satın alıp araziyi Lex'in şirketine rakip olacak bir şirket kurmak için kullanmaktır. Clark, kendi sırları olan yerel bir münzeviyle arkadaş olur.

Clark'ın güçleri, bir göktaşı ve fırtınanın tuhaf bir şekilde birleşmesi sonucu bir sınıf arkadaşına geçer. Clark ilk kez normal olmanın ne demek olduğuyla yüzleşmek zorunda kalırken, sınıf arkadaşı Eric yeni güçleriyle başa çıkamaz. Acaba Clark, Eric'in çılgınlığını yetenekleri olmadan durdurabilecek mi?

Whitney, kriptonit dövmeleri sayesinde duvarlardan geçme gücüne sahip eski sporculardan oluşan bir gruba katılır. Bu arada Chloe ciddi şekilde yaralanır ve Lex'in kendi planları vardır.

Lex'in geçmişinden bir adam, Club Zero'da Lex'in sorumlu olabileceği gizemli bir ölümle bağlantılı olarak onu takip etmektedir. Bu sırada Chloe, Clark'ın evlatlık olarak geçmişini araştırır.

Gübre fabrikasının yeniden açılan "Üçüncü Seviye"sinden gelen bir çiçek, Jonathan, Lana ve Pete de dahil olmak üzere birkaç kişide tuhaf tepkilere yol açar.

Genç bir kaçak olan Ryan, zihin okuyabilme gücüne sahiptir ve kendisini istismar eden üvey ebeveynlerinden kaçar. Ailesi onu yanına alır ve Clark kısa sürede çocuğun güçlerini ve bu güçlerden etkilenmediğini keşfeder. Ancak Ryan'ın üvey ebeveynleri, çocuğun güçlerini maddi kazanç için kullanmayı planlamaktadır... Lex'e karşı.

Tyler, dokunuşuyla organik maddeleri yok etme gücü kazanır ve ölmekte olanları acılarından kurtarmaya karar verir... Whitney'in babası da bir sonraki hedefidir. Bu sırada Lionel ve Lex, Lionel'ın Smallville'deki artan başarısı yüzünden çatışır.